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Novo estudo prevê antibióticos potenciais no global microbioma usando aprendizado de máquina

Um novo estudo usou aprendizado de máquina para prever 🍌 possíveis novos antibióticos no global microbioma, o que, de acordo com os autores do estudo, marca uma grande avanço no 🍌 uso de inteligência artificial na pesquisa de resistência a antibióticos.

O relatório, publicado à quarta-feira na revista Cell, detalha os achados 🍌 de cientistas que utilizaram um algoritmo para minerar "a totalidade da diversidade microbiana que temos na terra - ou uma 🍌 grande representação disso - e encontrar quase 1m de novas moléculas codificadas ou escondidas copa 2030 todo esse material escura microbiano", 🍌 disse César de la Fuente, autor do estudo e professor na Universidade da Pensilvânia. De la Fuente dirige o Grupo 🍌 de Biologia de Máquina, que visa usar computadores para acelerar descobertas copa 2030 biologia e medicina.

Sem um algoritmo assim, disse De 🍌 la Fuente, cientistas teriam que usar métodos tradicionais, como coletar água e solo, para encontrar moléculas dentro dessas amostras. Isso 🍌 pode ser desafiador porque micróbios estão copa 2030 todos os lugares - do oceano ao intestino humano.

"Isso teria levado muitos, muitos, 🍌 muitos, muitos anos para fazer isso, mas com um algoritmo, podemos classificar grandes quantidades de informações e apenas acelerar o 🍌 processo", disse De la Fuente.

Pesquisa urgente para a saúde pública

A pesquisa é urgente para a saúde pública, disse o autor, 🍌 porque a resistência a antibióticos causou mais de 1,2 milhões de mortes copa 2030 2024. Esse número pode aumentar para 10 🍌 milhões de mortes anualmente copa 2030 2050, de acordo com a Organização Mundial da Saúde (OMS).

Enquanto De la Fuente disse que 🍌 vê o estudo, que produziu o "esforço de descoberta de antibióticos mais amplo já", como um marco na possíveis benefícios 🍌 da inteligência artificial para a pesquisa, ele reconheceu que atores ruins poderiam potencialmente "desenvolver modelos de IA para projetar toxinas".

Ele 🍌 disse que seu laboratório implementou salvaguardas para armazená-los e garantir que as moléculas não sejam capazes de se replicar. Notavelmente, 🍌 salvaguardas de biosegurança não foram necessárias para este estudo porque essas eram "moléculas inertes".

Embora a inteligência artificial seja um assunto 🍌 quente nos últimos anos, De la Fuente disse que começou a usar AI na pesquisa de antibióticos há cerca de 🍌 uma década.

"Nós conseguimos acelerar a descoberta de antibióticos", disse De la Fuente. "Então, copa 2030 vez de ter que esperar cinco, 🍌 seis anos para chegar com um candidato, agora, no computador, nós podemos, copa 2030 apenas algumas horas, chegar com centenas de 🍌 milhares de candidatos".

Antes que a Administração de Alimentos e Drogas dos EUA aprove um antibiótico, ele geralmente passa por anos 🍌 de estudo por meio de pesquisa laboratorial e ensaios clínicos. Essas várias etapas podem levar de 10 a 20 anos.

Metodologia 🍌 do estudo

Para este estudo, os pesquisadores coletaram genomas e meta-genomas armazenados copa 2030 bancos de dados públicos e procuraram trechos de 🍌 DNA que pudessem ter atividade antimicrobiana. Para validar essas previsões, eles usaram química para sintetizar 100 dessas moléculas copa 2030 um 🍌 laboratório e, copa 2030 seguida, testá-las para determinar se elas podiam realmente matar bactérias, incluindo "algumas das mais perigosas patógenos copa 2030 🍌 nossa sociedade", disse De la Fuente.

79% das moléculas, que eram representativas das 1m moléculas descobertas, podiam matar pelo menos um 🍌 microrganismo - o que significa que elas poderiam servir como um potencial antibiótico.

A resistência a antibióticos é uma preocupação crescente 🍌 devido ao uso indevido e sobreuso de antimicrobianos copa 2030 humanos, animais e plantas, de acordo com a OMS.

Os autores do 🍌 estudo fizeram esses dados e código livremente disponíveis para qualquer pessoa acessar com o objetivo de "avançar a ciência e 🍌 beneficiar a humanidade", disse De La Fuente.